Dalam perjalanan pulang menuju Belanda, terjadi pertempuran di atas geladak kapal melawan pasukan Inong Balee yang dipimpin Laksamana
Malahayati tanggal 11 September 1599
Dalam pertempuran satu lawan satu dengan Laksamana Malahayati, Cornelis de Houtman tewas. Laksamana Malahayati ketika itu menggunakan Rencong, sedangkan Cornelis de Houtman menggunakan pedang.
Setelah perang berakhir kapal-kapal Belanda melanjutkan perjalanan pulang. Dari 249 awak, hanya 87 orang yang berhasil kembali.(*)